La misión del Observatorio, radica en impulsar y promover la investigación científica y la innovación en el ámbito territorial, a través de la coordinación y colaboración de los diferentes equipos y coordinadores del mismo, en aras de facilitar el desarrollo de proyectos de investigación de alto impacto, la formación de talento científico, la vinculación con el sector empresarial e industrial militar, y la gestión eficiente de recursos financieros y logísticos; así como contribuir al avance del conocimiento en áreas estratégicas para el Ejército Bolivariano, garantizando la seguridad y confidencialidad de la información generada en el proceso.